I. Hola Marcos, creo que antes de plantear un motivo concreto, es conveniente que un especialista revise la zona.
Dentro de mi ignorancia parece tratarse de una melanosis, (hiperpigmentacion), sin importancia en principio, aunque pueden darse casos de melanoma en esta zona según he leído, pero es muy extraño.
Esta melanosis en la gran mayoría de casos, es inofensiva, solo tiene un impacto estético, pero a veces no es así, conveniendo vigilar si se producen cambios de tamaño y relieve en las manchas.
No conozco bien este cuadro, ni soy quien para proponerle un tratamiento específico, pero he visto estas páginas con casos, me parece, muy similares al suyo, en concreto el del primer enlace, por favor díganos cual se corresponde más con lo que le ocurre.
http://fmcbormujos.blogspot.com/2016/09/manchas-negras-en-el-pene.html?m=1
https://salud.ccm.net/forum/affich-1087546-mancha-oscura-en-el-glande.
https://www.researchgate.net/figure/Figura-7-Otro-caso-de-Melanosis-en-glande_fig9_28249303
https://www.justanswer.es/urologia/8dunl-saldos-arde-el-pene-tengo-una-mancha-oscura-en-el-lado.html
Siento no saber ofrecerle un tratamiento concreto. Ánimo.