Tengo un contador de agua en casa,se pueden poner dos contadores

Si, pero habría que hacer una instalación desde antes del contador actual y llevarla hasta el 2º contador, y anular las tuberías que suben al segundo piso, tanto la fría como la caliente. Y después hay que colocar un productor de agua caliente para la planta de arriba.

Cuando hay solo un suministro es algo más complicado ya que tienes que demostrar que hay 2 viviendas ya que supongo que en escritura solo figurara una. El suministrador te pedirá la escritura de esa vivienda y sino la tienes posiblemente tengas que hacer una escritura nueva. Otra opción es que instales un contador privado para tu vivienda y el consumo tuyo lo restes del total del 1 contador y así sacar cual seria tu factura lo que simplificaría las cosas. Un salud