Prestación por riesgo durante el embarazo

Hola me gustaría saber es que ayer fui a mi médico de cabecera para comentar sobre las condiciones de mi trabajo, en el que por las mañanas hay que descargar mercancía, estoy de pie 6horas sin descanso, me tengo que agachar a coger cosas para los clientes, etc.
El caso es que me ha dado una baja por incapacidad temporal por contingencias comunes y ha puesto en el diagnostico lumbalgia. Al otro día fui a la seguridad social para averiguar por la prestación por riesgo dte el embarazo y me dijeron que tenía que ir a la mutua que me corresponde por la empresa.
Mi duda es que si el Médico de cabecera me ha dado baja por incap. Temporal voy a tener problema para pedir la prestación por riesgo dte el embarazo.