¿Enfermedades por tortugas en un cuarto?

Lo más común como dices es la salmonelosis la desarrollan y afecta en el intestino y luego al defecar y orinar la bacteria esta presente en el agua, para que desarrolle esa enfermedad la tortuga debe estar en malas condiciones, mala alimentación, mucho estrés y bajada de defensas etc etc pero aún así si es complicado contraer esa enfermedad si después de manipular las tortugas te lavas las manos bien con jabón o algún desinfectante no hay ningún problema. Lo más común es que en casas donde hay niños jueguen con ellas y luego se lleven la mano a la boca entonces así si seria fácil contraerla. Pero no debes preocuparte si las mantienes bien y te lavas las manos después de tocarlas..
Una cosa importante, deberías cambiarles el agua a menudo aunque tengas filtro y de todo por que así sera más difícil que la desarrollen.
Respecto a lo de tenerlas en la habitación... No te puedo decir, yo no las tengo más que nada por que para dormir hacen ruido :D pero si tienes un sitio a parte en tu casa donde las puedas poner, mejor no las tengas en la habitación que ahí es donde haces "vida" duermes etc... Por el aire no se contagia.