Problemas con multiinicio

Aunque tus explicaciones no dejan claro la capacidad de tu disco duro hay que ver dos cosas. Si instalaste w2k teniendo me instalado debería habértelo creado el, aunque si quitaste el otro disco duro es evidente que no. Si este segundo caso es el tuyo puedes hacer una cosa, activas y desactivas los discos duros desde la bios, desde w2k podrás acceder lo pongas como lo pongas a me pero no al revés (pues tienes ntfs)
Si esta solución no te gusta tendrás que instalarte un gestor de arranque (que es lo que querías) Aquí tienes uno
http://www.softonic.com/informacion_extendida.phtml?n_id=9555&plat=1
Khepper es dios

Perdón por el error, la capacidad del disco principal es de 20gb mientras que la partición es de 15gb (en vez de 25gb). Aunque esto no afecta a la pregunta. Sólo una cosa: ¿A través del LILO podría hacerlo? Ya que el gestor que me recomiendas no acepta discos mayores a 2 gb. Gracias.