Tienes varias opciones para pasar ficheros de Linux a Windows. En primer lugar, tienes la posibilidad de montar una partición de Windows en Linux, si ambos sistemas operativos están en el mismo ordenador. Esto se hace con el comando mount:
mount /dev/hda2 /mnt/discowindows -t vfat
Así, podrás montar la partición 2 del disco PCI primero en Linux, si ésta es de Windows. Una vez montada, puedes copiar los ficheros con los comandos de Linux: cp, mv, del, mkdir, rm, etc.
Otra posibilidad, si Linux está en un ordenador y Windows en otro, es que uses una red local para transferir los ficheros. Si ambos ordenadores los tiene conectados en red, simplemente instalas SAMBA en Linux y podrás ver las carpetas de Linux desde Windows, como un ordenador más de la red.
Una última posibilidad es que montes un servidor FTP o Web en Linux y con el Windows te conectes por FTP o por página WEB a la IP del Linux. Así también podrás transferir rápidamente ficheros de un sistema a otro.
Para instalar SAMBA, visita
http://lucas.hispalinux.es/COMO-INSFLUG/COMOs/Samba-Como/
Linux trae casi siempre un servidor FTP preinstalado. Y según como configures la instalación de tu distribución, podrás disponer rápidamente de un servidor web con Apache.
Suerte!