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Hola milton,
Realmente, la distribución no tiene mucha importancia siempre y cuando respete ciertas reglas de seguridad.
La distribución y versión que elijas, debe ser segura y poder obtener posibles parches y actualizaciones de paquetes, de forma que se asegure la instalación.
También hay que tener en cuenta que eres tú quien trabajará con el servidor, actuando de administrador, por lo que debes disponer de una distribución con la cual te sientas a gusto. Por ejemplo, yo vengo utilizando RedHat Linux desde la versión 4.2, habiendo utilizado otras (empecé con Slackware en el 94, probé Suse 4.3,..).
Sobre montar un servidor bajo Linux, creo que es una opción muy provechosa, tanto en ahorro de costes en software como en hardware. No necesitarás una misma máquina para montar un servidor basado en plataforma M$ que en plataforma Linux. Con este último, los requerimientos hardware son menores, siendo el rendimiento mayor.
Habiendo escogido la plataforma (tipo procesador + distribución Linux), tendrás que elegir qué servicios instalarás en tu servidor y la forma de optimizar la administración de los mismos. También hay que tener en cuenta para qué necesitarás el servidor. No es lo mismo un servidor de desarrollo web (Apache, PHP, Tomcat, CVS, MySQL, PostgreSQL, ..) que un servidor de correo electrónico (Qmail, LDAP, ..).
Las ventajas: rendimiento y bajo coste de la solución.
Si quieres más información, especifícame para qué quieres instalar/configurar el servidor y te comento más cosas.
Slds,
iCesofT
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