¿Sangrado intermenstrual puede ser por fallo de pastillas anticonceptivas?

Mi novia estuvo tomando amoxicilina y pastillas anticonceptivas y no utilizamos ningún otro método para cuidarnos, aquí ya me aclararon que la amoxicilina no interfiere con las pastillas anticonceptivas pero mi novia tuvo un pequeño sangrado y no era su periodo, también le salió un poco de flujo marrón, y leí que esto se puede deber a que las pastillas están fallando, ¿es efectivamente así o se debe a otra cosa?