Problemas con el disco duro

Prueba a hacer lo siguiente:
Abres ejecutar y escribes cmd
En la ventana que te aparece usas chkdsk /F C:
Y le dejas que ejecute

Tu problema no es de windows, ni del disco duro, el problema es de virus, descarga esto, primero desinstala tu antivirus, te voy a dar 3 programas para quitar todo lo malo que pueda tener tu computadora, ¿cómo se que es virus? A mi también me ha pasado
Spybot Search & Destroy
http://www.filehippo.com/es/download_spybot_search_destroy/
Malwarebytes Anti-Malware
http://www.filehippo.com/es/download_malwarebytes_anti_malware/
Y para rematarla Kaspersky
http://www.kaspersky.com/sp/trials
El kaspersky solo debes instalarlo en version de prueba, actualizas y luego de actualizar analizas con full scan, y con eso no quedara nada de virus en tu computadora.
Me avisas como te fue.

Pueden ser archivos de sistema que genera windows 7 y también archivos ocultos o un fallo de asignación de espacio en la NTFS.

Puedes hacer lo siguiente:

Entra en el disco duro (unidad C:\) y selecciona todos los archivos con el ratón o con "control+e" y pincha con el botón derecho del ratón sobre uno de los seleccionados eligiendo la opción de "propiedades" te saldrá todo el espacio real de la unidad que siempre es entre 2 y 4 GB menos que el que te marca dándole directamente a propiedades en la unidad C:\ pero esto es normal.

Para mirar si es algún archivo oculto puedes seguir este manual:

http://www.holacape.com/2008/07/mostrar-archivos-ocultos-en-windows.html

Luego con el buscador de windows selecciona todos los archivos que ocupen mas de 50MB o 50.000KB ya que estos archivos suelen ser archivos temporales a la hora de grabar DVD que se hayan quedado sueltos aunque hay que tener mucho mucho cuidado a la hora de borrar archivos ya que si no estas seguro puedes dañar windows.

Para comprobar si es un error en la NTFS puedes pasar el scandisk de windows así:

http://menteprincipiante.com/2010/11/como-usar-scandisk-en-windows-7/

Ademas este manual te puede servir para liberar mas espacio:

http://www.malavida.com/blog/14569/como-liberar-espacio-en-windows-7

Si no quieres preguntar nada mas por favor cierra la pregunta para que se publique y poder ayudar a otros usuarios

Entiendo tu problema. Una ves me paso. Lo que hice es lo siguiente... entre al C y a cada carpeta le hice click derecho y le di a propiedades... y hay me fijaba lo que ocupaba. Cuando encontré la carpeta.. entre a la misma y aparecieron 20 carpetas más.. y de a 5 carpetas iba señalando y les hacia click derecho y propiedades... así hatsa que iba encontrando las que ocupaban y que tenias... todo esto asumiendo que tienes la opción de ver las carpetas ocultas... en el caso de que no tienes la opción de verlas... abrí cualquier carpeta de windows y apretá la tecla ALT para que aparezca la barra arriba... anda a la opción HERRAMIENTAS dps a OPCIONES DE CARPETA... y en la pestaña VER marca la opción MOSTRÁ ARCHIVOS, CARPETAS Y UNIDADES OCULTAS...