¿Lleva iva?

Buenos días,
Tengo que hacer una factura a una empresa de transportes por una mercancía que nos ha devuelto un cliente por no ser entregada a la hora, y la cual se quedará la agencia de ttes. Con dicha mercancía. La factura que le tengo que hacer a la agencia de ttes. ¿Lleva IVA?
Saludos, y gracias de antemano