Duda sobre las pagas extraordinarias

Recurro a ti de nuevo para que me resuelvas una duda.
Llevo trabajando en una empresa de transportes desde el 15 de junio. He cobrado la paga extra de verano y me la han dado diguiendo este planteamiento:
Si hubiera trabajado 365 días, ¿me corresponderían 900?, pero como he trabajado 15 días, me corresponde X.
Mi duda está en que si se supone que es una de las dos pagas extraordinarias, la regla de tres debería ser proporcional a medio año, no al año entero, pero en mi empresa me dicen que cobro no por los 6 primeros meses del año, sino que el cómputo se realiza según lo trabajado desde el 1 de junio de 2004 hasta el 31 de junio de 2005, y que lo mismo pasará con la de Navidad, que computa desde el 1 de diciembre de 2004 hasta el 1 de diciembre de 2005.
Según tenía entendido, las pagas eran proporcionales a cada mitad de año, es decir, la paga de verano era proporcional a lo trabajado desde enero hasta junio, y la de Navidad, proporcional a lo trabajado desde junio hasta diciembre.
¿Es normal que lo hagan así? ¿No debería ser por lo trabajado en 6 meses?
Te agradecería infinitamente que me resolvieras esta gran duda, porque me ha chocado mucho la explicación que me han dado.