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Copiar estructura de carpetas con ficheros selectivos

Busco la manera en windows o en unix de solucionar el siguiente problema. Tengo una estructura de carpetas que constan de los nombres de pueblos de una provincia, dentro de cada carpeta de cada pueblo hay numerosas carpetas y dentro de ellas "puede"...
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Mostrar JList con JTextField al lado de cada eleme

A ver, mi consulta es algo complicada. Estoy añadiendo una opción a un programa de voto electrónico JFreeVote (http://jfreevote.hispalinux.es/) ahí hay código fuente y todo (entero para descargar, o en documentación entrando com o si estuviese...
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