¿Evitar que msgbox de alerta se repita?

Ponga un punto de interrupción en la línea de limpiar el contenido, y vaya ejecutando el proceso paso a paso con F8, ahí vera en que momento entra al mensaje, de esa manera podrá corregir el código a manera de que no pase por el mensaje.

Quiero que aparezca el mensaje de Si o No, y ya sea que se ejecute la macro o no, limpie el contenido de la celda donde se introducen los datos que en este caso es B3, anexo el código, podrían explicarme cómo hacer eso, no logro que funcione ya que no soy experto en macros y todo lo que ven es de lo que eh podido encontrar en la red, tal vez las soluciones propuestas funcionen pero no sé cómo aplicarlas :/

Option Explicit

Dim B3C3 As Long
Dim BC3 As Integer

Private Sub Worksheet_Change(ByVal TARGET As Range)

Dim RESP As Byte
If TARGET.Address = "$B$3" Then
RESP = MSGBOX("¿ESTÁN CORRECTOS LOS DATOS?", vbQuestion + vbYesNo, "CONFIRMACIÓN")
If RESP = vbYes Then
MSGBOX "SE ELIGIÓ CONTINUAR", vbExclamation, "CONFIRMACIÓN"
BC3 = BC3 + 1
If BC3 > 1 Then
Exit Sub
End If
B3C3 = B3C3 + Sheets("Hoja1").Range("B3").Value
Sheets("Hoja1").Range("C3").Value = B3C3
End If
Else
If RESP = vbNo Then
MSGBOX "NO SE INTRODUCIRÁN LOS DATOS", vbCritical, "CANCELACIÓN"
End If
End If
End Sub
Private Sub Worksheet_SelectionChange(ByVal TARGET As Range)
B3C3 = 0
BC3 = 0
If TARGET.Address = "$B$3" Then
B3C3 = Sheets("Hoja1").Range("C3").Value
End If
End Sub

Puede subir una copia de su archivo con algunos datos ficticios para correr la macro y ver en donde sale el mensaje que no desea que aparezca, porque con este código no puedo reproducir el proceso y en que momento pasa por la parte donde limpia el contenido de la celda.

Agrego enlace de descarga, en la columna C we introducen los metros, si se elige que si, se muestra dos veces el mensaje de confirmación, y si se elige que no solo se muestra una vez

https://mega.nz/#!HRoz1aDI!SfTJ2pk2LkSYUhubd_mEpWhHVb0BPZcnnhqDIGQR12E 

Ya tengo el archivo, pero no me queda muy claro que es lo que necesita corregir o que no haga y en que momento, podría explicar, o subir imágenes del mensaje donde no quiere que aparezca

Estoy probando otra cosa, tan pronto termine subo enlace de descarga, de igual manera muchas gracias por estar al pendiente

Al introducir números en la columna C, aparece un mensaje, al elegir SI, el número de acumula en la columna D, en sus filas correspondientes, si elige NO, no hace nada, y la columna D permanece sin cambios, lo que me interesa es que ya sea que el usuario elija SI o NO, el número que haya escrito en la columna B se elimine, no puedo subir capturas ya que estoy desde mi celular, pero anexo el archivo, la contraseña es "SKINS", sin comillas.

https://mega.nz/#!mdRUkaqa!qfmBtkYMOpPj87L-luCoMoNszdouQPkJ6RQywunb7UU