Debo dinero a mi empresa y quiero dejarla

Debo dinero a mi empresa del sector comercio por unas compras que realicé. Ahora me ha salido un trabajo nuevo y quiero marcharme pero no se de qué forma afrontar el pago ya que tengo que pagar hipoteca, gastos etc y no me va bien pagarlo todo de golpe. ¿Se puede llegar a algún acuerdo extinguiendo la relación laboral pero no la económica hasta que no pague la deuda en su totalidad?