La propuesta de talavarano puede ser que quizás no funcione, pues el VLc guarda en un archivo las 'preferencias' de quien las usa y así en cada nueva instalación aparece la misma opción que se tuvo en la version anterior.
Si aquí se da el caso, deberás entrar al programa y buscar la manera de solucionar lo que al parecer se hizo previamente. Estos errores, jamas ocurren sin la intervención del usuario y es la consecuencia de entrar a probar opciones sin saber lo que se está haciendo.
Por lo tanto, buscaremos resetear el VLC. Será algo más largo que reinstalarlo, pero es la alternativa en caso no funcione.
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1. En la pestaña 'herramientas', entrar a la opción 'preferencias' y hacer click en la opción que aparece al pie de la ventana que dice 'restaurar preferencias'.
Cerrar el VLC y luego probar.
En caso siga el problema...
2. En la pestaña 'video', marcar la opción 'siempre ajustado a la ventana'. (Cerrar y luego probar)
3. En la pestaña 'herramientas', entrar a 'efectos y filtros'. Entrar a 'efectos de videos'. Desactivarlo todo en cada una de las 7 pestañas que tiene esa opción. Todo debe quedar en blanco. (Cerrar y luego probar)
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Regresa y avisa si funcionó.
Suerte.