Formateo y demás

Hola
El ordenador se me estropeó y empezó a mirarlo un amigo de mi sobrino, así que no sé que hizo, pero el ordenador está encendido en A modo de prueba y desde ahí he estado salvando algunas cosas.
Pero ahora me ha dejado plantada pues se ha ido a los San Fermines.
He intentado formatearlo, pero al principio el disco C no me ha dejado. Salía una advertencia diciendo que perdería los indicadores o algo así y ya no servirían. Daba a aceptar y tampoco me dejaba, decía que estaba ocupado.
El disco E también me ponía la 1ª advertencia pero luego me dejó formatearlo.
He llegado hasta ahí y una ayuda no me vendría mal.
Si te hace falta anotaré lo que me pone exactamente cuando le doy a formatear.
¿Cuándo están los discos formateados, que pasa con la conexión a Internet?
¿Se pierde o continúa cuando ya has instalado el sistema operativo?
¿Qué sistema operativo es mejor?
Si tienes uno con licencia y los otros no ¿Hay mucha diferencia en usar uno u otro?
Gracias por todo
Saludos