Mi novia ha tenido manchas de flujo color café, ¿Es a causa de tomar glanique?

Antes que nada gracias por tomarte la molestia de contestar.
Tuve relaciones con mi novia el segundo día de su regla que fue el 16 de Marzo y se rompió el condón, tomo glanique el 18 y su periodo siguió, pero se alargo un manchado café por dos o tres días más. Tuvimos de nuevo relaciones el 21 del mismo mes con condón en varias ocasiones pero ella seguía manchando sus protectores un poco con pequeñas manchas café y de nuevo el 06 de Abril tuvimos relaciones con condón, siempre ha sido regular en sus periodos de 28 días con poca o nula variación, se supone que los días de ovulación serian alrededor del 28 o 29 de marzo, lo que creo reduciría el riesgo de embarazo, pero ahora tiene un retraso ya de 4 días, ya que debió llegar su regla el 12 del presente.
Me gustaría saber si es normal este retraso por el uso de la pastilla de emergencia y si esos días de más que duró con mancas cafés son normales. TAMBIÉN tomar en cuenta que no es la primera vez que toma la pastilla, a mediados de febrero también tomo la pastilla pero su regla llego en las fechas normales. Que probabilidad hay de embarazo y saber en cual de las ocasiones pudo haberse dado tomando en cuenta las fechas, así como cuanto tiempo debemos esperar para hacer un test.