Sanción por contestar fuera de plazo?

He respondido a una notificación del SEPE unos días más tarde 2 o 3 aproximadamente. O sea fuera del plazo para ello.

En ella me piden el pago de algo que no me corresponde y me conceden un plazo de 3 meses para pagar.

La notificación está comunicada con un escrito de alegaciones y adjunto fotocopia de la prueba para su conocimiento.

Por otra parte, he solicitado una prestación "que nada tiene que ver" con el asunto anterior y en la que interviene este organismo.

¿Es posible que no me concedan esta presentación en base a no haber cumplido el plazo de la anterior notificación?