Convenio de intervención social y cotización a la SS.SS.

Trabajo en una ONG que se adscrito este convenio. Hasta ese momento nuestra jornada laboral completa era de 37 horas a la semana y se cotizaba por una jornada completa. Ha llegado una nueva Junta Directiva que ha decidido cambiar de asesoria y desde este momento nos dicen que anteriormente se había estado haciendo todo mal porque se debía cotizar por 40 horas que "eslo que todo el mundo debe hacer por la jornada completa". El problema radica en que la entidad no puede asumir los salarios del convenio por lo que nos han reducido la jornada laboral, así que ya casi todos trabajamos menos de las 37 horas, por tanto hemos pasado a jornada parcial. La pregunta es, la nómina como la deberían calcular, ¿en base a la jornada completa que eran las 37 horas o a las 40 horas que la gestoría dice que es la cotizacion total? El caso es que las compañeras que trabajan las 37 horas no tienen problemas pero claro yo trabajo 36y la reducción en horas es solo de una pero en salario es mucho mayor ya parten de las 40 horas para hacer sus cálculos y no de las 37 horas que era la mejora de convenio que teníamos. Espero haber explicado bien el problema y agradezco de antemano su ayuda.