¿Hay problemas con la eficacia de las pastillas?

¿Si los problemas gastrointestinales perduran pero aun así pasan más de 12 horas de haberme tomado la pastilla absorción afecta eficacia de las pastillas?

Llevo tres días con diarrea en las mañanas al rededor de las 10 de la mañana y yo me tomo a las 8 de la noche mis pastillas