Diferencia coste hora jornada completa y jornada reducida

Tengo jornada reducida por cuidado de un menor y el coste hora para la empresa es menor que si estuviera trabajando la jornada completa. ¿A qué se debe esa diferencia en el coste/hora?  La empresa tiene algún tipo de bonificación para estos casos? ¿El coste/hora no debería ser el mismo ( antes y después de la reducción de jornada por maternidad), independientemente de las horas trabajadas si el contrato no ha variado?