Consulta Baja por maternidad alta 3 meses y medio antes

Estaba cobrando la prestación por desempleo, pero una empresa que contaba conmigo para trabajar, aún sabiendo que estoy embarazada de 25 semanas, me ha contratado hoy, he llamado al SEPE y he solicitado la baja de la prestación ya que he empezado a trabajar. Probablemente a mediados de abril tenga que darme de baja por riesgo o algo por no poder desplazarme al lugar de trabajo, y mi fecha probable de parto es el 19 de mayo... ¿Puedo tener problemas para cobrar luego la baja por maternidad? El darme de baja tan tarde ha sido porque aún no se había abierto el centro de trabajo, ahora vamos a organizarnos y a llevar yo las cosas un mes y el mes siguiente le explico a mi jefe como se hacen las cosas y se quedará el en la oficina para atender a la gente y cuando tenga que salir a trabajar fuera pondrá un cartel que indique que están trabajando fuera que llamen por teléfono...