¿Cómo cobrar comisión en mi nómina?

Estoy trabajando como administrativa y por restructuración de la empresa debo realizar también trabajo como coach. En dicha empresa este puesto existe siendo autónomo y suelen cobrar un fijo y un porcentaje por ventas.

Mi fijo no lo van a tocar, aún implicando que mi trabajo vaya a duplicarse, pero me comentan que el variable/comisión tienen que pensar cómo hacerlo. Por que para ellos dicen que no es lo mismo pagar 300e a un autónomo de comisión que pagarme esos 300e a mi. He de decir que esos 300e no salen de la empresa sino del cliente.

Entonces, ahora estamos en periodo de negociación de dicha comisión. Lo que yo pienso es que debería cobrar esos 300e en bruto, junto a mi nomina bruta. Ej. 1285e + 300e de comisión. Ellos me plantean que de esos 300e primero quiten la parte proporcional de la empresa a la ss. Con lo cual no serían 1285+300 sino que seria mucho menos.

¿Cómo debería ser? ¿Qué puedo plantear a la empresa para que ninguna de las partes salgamos perdiendo?