Desde cuándo contar el ciclo menstrual?

Desde enero de este año tomé pastillas Diane para deshacer un quiste que tengo, me las envió el ginecólogo por cinco meses. Había sido muy regular mientras las tomaba pero para este ciclo que debía llegar el sábado 29 de julio no fue así.

Llevo cinco días de retraso y el miércoles por la noche comencé a manchar café pero únicamente al limpiar la orina. La toalla sanitaria sigue limpia, sin ningún tipo de mancha.

Se que no es embarazo puesto que no he tenido relaciones sexuales. Pero me gustaría saber qué sucede y, en estos casos, desde qué día contar (desde ahora o hasta que el sangrado baje bien) porque el ginecólogo me mandó Perfil Hormonal exacta en el día 22 de mi periodo y no sé cuándo sería éste debido a esta condición.