16 días de retraso pero me cuide con perservativo

Hola,generalmente soy bastante irregular . Tuve mi última menstruación el 1 de julio y tuve relaciones el 15, nos cuidamos y no hubo ningún accidente, el perservativo no se rompio.

Una semana antes de que me viniera este mes , tuve por dos dias un flujo marron. Me hice un test de embarazo y dio negativo.  Que podría estar pasando? Todas las veces que tuve relaciones use perservativo. 

Gracias.