Problemas con php y MYSQL

Bueno estoy desarrollando un sistema de web en el que utilizo mucho php y mysql en mi versiones anteriores me funciono todo pero en la ultima version donde uso algunas aplicaciones, no me función
Puede ser mi version de php y mysql
Tengo
php 4.0.6
Mysql 3.23.32
En el servidor
php 4.0.4pl
Mysql 3.23.22beta
No se cual puede ser el problema
Sera la diferencia de tablas de una version a otra
o las distintas versiones que exite:)
Gracias por ayudaç