Un archivo pdf no se puedeincluir en flash directamente, lo tendías que exportar a través de freehand, aunque el resultado podría ser no muy convincente pues el archivo final pesa demasiado, en cambio flash tiene algo mejor que eso se llama flashpaper que funciona exactamente igual que pdf con la ventaja de que el archivo final pesa unos pocos kb, funciona como una impresora, que al igual que pdf imprime a un archivo solo que en el caso de flashpaper lo imprime directamente a un swf, con lo que incluirlo en una presentación ya resulta fácil, ademas tiene la ventaja de que incluye un menu bastante discreto con opciones como imprimir y zoom. En lo particular el programa me ha funcionado bastante bien.
http://www.macromedia.com/software/contribute/productinfo/flashpaper/