Autopromoción vivienda, IVA, IRPF

Este año he comenzado a construir una vivienda familiar para uso propio.
Estoy contratando yo directamente a las empresas que están ejecutando los trabajos: excavación, albañilería, electricistas, etc.
Estas empresas las facturas que están emitiendo tienen el 7/% de IVA, ¿es correcto?
La duda me surge porque una de ellas es una sociedad civil y en su factura pone el 7% y el 1% a mayores y me dicen que por ser una S.C. Tienen que hacerlo así, ¿es cierto? Yo he pagado el importe total de esa factura, ¿qué ocurre con ese 1%? ¿Tengo qué hacer algún trámite?
Cuando tenga que hacer la declaración de la renta, cómo hago para desgravar lo máximo posible.
Gracias.

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