Restauración ventanas y vigas de madera

Siguiendo el orden de tus preguntas te diré que aunque no te gusten los tratamientos químicos creo que son necesarios, sobre todo cuando esas ventanas dan al exterior, puedes darle aceite de linaza con secante, pero no estaría mal que antes les dieras algún producto protector como el xiladecor, este es bastante bueno y da unos resultados excalentes.
En cuanto a las vigas de interior si las destapas puede que estén manchadas o "quemadas" por el yeso, intenta hacer una prueba y si están en buen estado destapalas totalmente, para limpiarlas puedes usar agua jabonosa en caliente o con un poco de amoniaco, y después agua caliente sola, para tratarlas, si son de interior puedes darle aceite de linaza o simplemente cera virgen.
En cuanto a la silla, conozco esos bicomponentes y pienso que siempre es mejor y le dará más solidez si pones una pieza nueva. Una cosa, si encolas la silla acuérdate de limpiar antes los restos de cola anterior y de hacer presión con gatos mientras seca la cola.
La cola animal es buena, la única usada hasta que llegó la cola blanca, pero dado la dificultad de su preparación (al baño maría, una densidad apropiada, etc.)te recomiendo que uses una cola blanca de buena calidad, ya sabes, como en todo hay marcas mejores y peores, busca una buena, te diré alguna por si puedes conseguirla: Vidicol, Whurt.
Espero haber contestado a tus preguntas, si no es así o tienes más dudas, vuelve a preguntarme, si esta en mi mano te ayudare.