Certificado de empresa tras subrogación empresas del mismo grupo

Llevo 13 años trabajando para una empresa. En junio me subrogación con un anexo en el que se indicaba que se respeta la antigüedad y derechos. Mi duda es si ahora me despidiesen en el certificado de empresa deberían aparecer los 180 últimos días. Son empresas del mismo grupo. ¿Si solo apareciesen los 90 días que llevo desde la subrogación podría tener problemas?