Baja por riesgo embarazo a través de la mutua

He estado de baja a través de la seguridad social el primer trimestre de embarazo (no por complicaciones en el embarazo). Ahora estoy de 25 semanas y mi empresa me ha propuesto pasarme a la mutua ya que voy a recibir en alta en breve y no me pueden adaptar el puesto.

Tengo entendido que la mutua paga el 100% del salario, pero al haber estado de baja por la seguridad social mi nomina se ha visto reducida.

Mi pregunta es si voy a cobrar a raíz de la ultima nomina (baja seguridad social) o directamente pagan según convenio lo que tengas establecido o mi salario anterior el cual era bastante más alto.