Ocultar sub carpetas en url con htaccess

Espero encontrarme con alguien que domine htaccess porque yo ya me di por vencido :(

En la actualidad requiero ocultar las dos sub carpetas en las cuales tengo instalado un script. Este script requiere para su funiconamiento el htacces que publicare para su funcionamiento, por ello se requiere dicha estructura como mínimo

<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine On
RewriteCond %{HTTPS} off
RewriteCond %{SERVER_PORT} 80
RewriteRule ^index\.php$ - [L]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule . /Sub_Carpeta_1/Sub_Carpeta_2/index.php [L]
</IfModule>

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