Duda sobre inyección anticonceptiva luego de relación sin protección

En junio me apliqué por primera vez la iny anticonceptiva mensual y desde entonces la he estado aplicando cada 4 semanas y he tenido el periodo en tiempo y forma.
He usado preservativo la mayoría de las veces, y como ayer (23/8) usé preservativo y en otra ocasión utilicé el método natural (marcha atrás, eyaculando afuera).
Hoy, 24/8 me inyecté la anticonceptiva del mes y además de que me molestó la zona muscular donde me la aplicaron, en la tarde tuve flujo marrón. No quiero asustarme con un embarazo porque pienso que no es posible, he aplicado la inyección en tiempo y forma desde hace 3 meses, y además de usar preservativo siempre, con mi pareja somos muy cuidadosos y prestamos atención a que acabe afuera y todo eso.
Otro dato que quizá es importante es que, el mes pasado utilicé una marca de inyección y este mes me aplicaron otra. ¿Será un efecto de la misma aplicación?