Duda acerca de las pastillas anticonceptivas

En diciembre tuve que dejar de tomar mis pastillas anticonceptivas debido a que en mi país no se conseguían, tuve relaciones sexuales con condon y mi menstruacion me vino el 16 de diciembre, pero me tocaba el 6 de enero y no ha venido mi menstruacion, a que se debe la usen la de mi menstruación si me he cuidado con preservativo.

Antes de iniciar con las pastillas yo tenía ovarios poliquisticos y llevaba tomando las pastillas durante 5 años, ¿puede ser eso un factor?