¿Se ha de notificar un alta por incoparecencia?

Tras ir a recoger el parte de baja, me encuentro que me han dado el alta por comparecencia desde el día 1/10 por tardar en recoger los partes, sin nadie notificarme el alta por ningún medio, ni ib-Salut, ni mutua, ni empresa... ¿me vuelven a dar de baja el día 16/10 y me dicen que los días quechua me quedan en medio le diga a la empresa que me los quite de la vacaciones. Me puede hacer un despido procedente por este hecho? ¿Las altas médicas se han de notificar siempre?