¿Cambia el salario base y el devengo convenio por haber estado de baja?

He estado de baja extralaboral cinco días, y en la nómina del mes que estuve de baja he visto que ha variado mi Salario Base y la cantidad de devengo en Convenio (ambos son más bajos -además de otras percepciones). Me gustaría saber si es normal que en esta nómina las cantidades (de salario base y devengo convenio) sean más bajas, ya que el plus de transporte sí me lo han bajado debido a que en mi convenio colectivo pone que solo me pagan los días trabajados.