¿Manchado tomando aun la píldora?

Mi novia toma la píldora desde hace dos años, este mes se tomo todas las píldoras a su hora, pero tubo un ligero manchado dos días antes de empezar la semana de descanso, ahora le tenía que bajar pero aun no le ha bajado! ¿Seria esa ya la regla aquel ligero manchado? Este mes esta utilizando un tratamiento de una pomada para tratar una fisura anal y estuvo algún día de diarrea pero leve, más que nada heces muy liquidas. ¿Podría el tratamiento interferir en la Píldora? Porque el medico que se lo receto no la aviso de ningún efecto. ¿Podría estar embaraza? Este mes hemos tenido relaciones un par de veces solo y aunque siempre eyaculo con condón si que hubo alguna penetración sin el. Estoy un poco intranquilo por esto.