Comprar mercadería en china, proveedores

Buenas tardes, tengo el programa de Gabilos, a la hora de introducir una compra de material de China tengo un problema, le pago la base al proveedor chino y el IVA al agente de aduana. El programa me obliga a introducir los datos por una plantilla prediseñada en la que solo puedo poner un proveedor, entonces mi duda es saber si como la base se la pago a uno y el iva a otro, ¿para arreglarlo compenso proveedores?

Y otra duda, si se adelanta el pago de la mercancía al proveedor chino y en la aduana la mercancía tiene otro valor, ¿a qué cuenta llevo ese ajuste?

Por ejemplo compro en enero 10.000€ y cuando llega la mercancía en aduana se paga IVA correspondiente a 9500€, ¿dónde llevo los 500€ de diferencia?

Gracias