Contabilizar solo el iva de una factura

Se le requiere a una empresa para que justifique el iva soportado del año anterior, al no contestar dicho requerimiento se liquida el iva repercutido de todo el año, debiendo pagar todo el iva que ha repercutido, sin considerarle el soportado. Solo se le hace inspección por IVA y no por sociedades, por lo tanto el gasto si se ha considerado. ¿Como se contabiliza ahora las facturas que la agencia tributaria nos han retirado, para que no entre en gasto, solo a efectos de que nos devuelvan el IVA soportado?