Como pasar mkv 3d a mp4 en3d

hola tengo la sony bravía 3d pero esta desaprovechda ya que solo puedo ver en 3d pelis compradas,me han comentado la opción de un reproductor multimedia o disco multimedia ,y he visto en los foros la opción de convertir el formato mkv en 3d al mp4 en 3d que este si lo lee la Play Station S3,desconozco el programa que lo ejecutaría, por favor deme una explicación de lo que le he indicado y en términos fáciles pues soy novato en el tema y con su explicación ya me decantaría poor alguna de esta opciones r