Script de hay un mensaje no leído, ayuda

buenas tardes,el tema es que estoy buscando un scrpit el cual cuando el usuario reciba un mensaje salga mensaje no leído y cuando no haya ponga no hay mensajes no leídos lo típico de una pagina,hice el sistema de mensajería en php y msql pero el tema que puse la advertencia con echos(una chapuza),que el usuario tiene que entrar en la bandeja de entrada para saber que si hay o no sms.

EL tema seria cambiar eso,encontré que se hace con javascript con setTimeOut pero ni idea de como,alguien que me ayude??