¿Tengo una duda si estoy embarazada o que tengo?

Yo me doy la vacuna anticonceptiva mesyina cada 28dias, me la di el 29 de agosto, el 29 de agosto me bajo un flujo marrón de dos días, nunca me pasa esto, con mi novio hemos tenido relaciones sin usar condón, siento mucho dolor en los senos, me hice evatest y test embarazo sanguíneo y dieron negativos los dos, que puede se??