Se puede despedir estando de baja?

???Soy un pequeño empresario (tres empleados) y tengo una trabajadora que nos está haciendo la vida imposible a todos. Hemos tratado de hablar con ella y pensando que la ibamos a despedir se ha cogido la baja por enfermedad común??
Ahora sí que quiero despedirla, ¿a qué me enfrento?
Gracias