Venta al por menor y editorial: ¿Compatible?

Hola!

soy autónomo y estoy sujeto al régimen de equivalencia. Tengo epígrafes de venta al por menor de artículos musicales y ahora voy a darme de alta en el epígrafe 476.9 Ediciones Musicales. Me comentan que deberé hacer unan declaración trimestral de IVA "paralela" al régimen de equivalencia de lo que genero con esta actividad. Que las compras relacionadas directamente y ventas de esta actividad tengo que declararlas aparte. Es esto compatible? No se pueden generar problemas contablemente? Además a los clientes se les vende tanto ediciones sujetas a este epígrafe como otros artículos y todos en la misma factura.

Espero haberme explicado. Quien me pueda ayudar le estaré muy agradecido.

Saludos