Pago de la última cuota de una obra

He comprado un piso en construcción, por el que he firmado un contrato de compraventa. En la cocina decidí hacer unos cambios, de los que se iba a encargar la empresa que montaba las cocinas de obra, y por los que hice 2 pagos a cuenta por el 75% del valor de los cambios. Pero esa empresa sólo hizo una parte de la obra (estructura y silestone), pues no le suministraban el resto del material ya que tenía unos pagos pendientes. En la constructora me dijeron que el resto del montaje (puertas y electrodomésticos) lo asumían ellos, que se lo encargaron directamente a Fagor, y que estará incluido en el libro de la obra, de manera que yo tenga garantía de todo.
Ahora me dicen en la constructora que la empresa de cocinas le ha pasado la factura con los importes pendientes, y me dicen que ese 25% restante se lo dé a ellos, que ellos se lo darán al dueño de la empresa.
Además, todavía no han colocado los electrodomésticos, y no quería hacer el último pago antes de que toda la cocina esté totalmente instalada.
Mi duda está en si ese último pago lo debo hacer a la tienda de cocinas, o a la constructora, porque no entiendo que una empresa no haya hecho su trabajo, y aún así se le entreguen las cantidades pendientes de cobro del presupuesto que me había hecho.
Además en la constructora me han dicho que ya que la tienda de cocinas va a entrar en suspensión de pago, otros clientes no están pagando el IVA, y que como no necesito factura, que me lo puedo ahorrar. Pero según la hoja de liquidación que me han dado, ese IVA que me ahorro es el 18% de la cantidad pendiente de pago (en este caso, ¿110'59? , de los 725? Pendientes de pago), es decir, que habré pagado el IVA del 75% del presupuesto, y no lo estaré pagando por el otro 25%.
Volveré a ir a la constructora para que también ellos me aclaren estas dudas que me han quedado, pero antes quería saber también su opinión sobre esto.
Gracias. Un saludo.