Como Escriturar un piso

Buenas noches, mi caso es el siguiente, a mi novio le ha tocado un piso de protección oficial por cooperativa, ¿el cuál ha pagado 50000? Por su cuenta antes de que estuviéramos juntos, en aquel momento le dieron unas ayudas cuando el estaba solo, ahora al ir a firmar la hipoteca nos han dicho que vamos a perder ayudas y que ya es tarde para ponerlo a nombre de los dos, ya que yo estoy ayudándole ahora a pagar, y que cuando nos casemos no hagamos separación de bienes para que el piso sea de los dos. Si firma la hipoteca el solo, podríamos poner la escritura del piso a nombre de los dos, o como podría yo justificar el día de mañana si la cosa fuera mal que yo también he pagado parte del piso. Gracia