Complemento de convenio pagado en exceso

Hola buenas tardes,

quisiera que me ayudaran a resolver la siguiente duda. Que se debería hacer si durante años un trabajador está percibiendo un complemento salarial, establecido en convenio colectivo de aplicación, por encima de lo que realmente le corresponde ya que en su día se calculó mal. Este complemento ha ido evolucionando en la negociación colectiva y se le ha ido practicando el aumento estimado cada año. Se podría aplicar la cantidad correcta en dicho complemento y el exceso dejarlo como un complemento absorbible?(entiendo que no se le puede restar cantidad alguna en la nómina por haberse consolidado)

Muchas gracias y un cordial saludo.

Cristina.