¿Cómo actuar si mi pareja tiene dudas y quiere tiempo?

Llevo 14 años de convivencia con mi pareja. Hace unos meses que la cosa no iba bien, que ha sido el desencadenante que tensiones en nuestra relación. Reconozco que no había un exceso de comunicación, debido a esto creció más aun, cuando descubro por casualidad un mail con contenido sexual, fantasías hacia otra persona. Fue muy duro para mi, he caído en una depresión.
Por suerte, he mantenido la compostura, el respeto, el dialogo. He sacado fuerzas para no empeorar más de lo debido. En todo momento he sido sincero con ella de mis sentimientos, le he dicho lo mucho que la quiero, lo importante que es en mi vida...
A raíz de preguntas y hablar, me dice que tiene dudas sobre sus sentimientos, que necesita espacio y tiempo alejado de mi, que necesita aclarar sus ideas, necesita volver ha sentirse viva, estar al 100% por mi. Me quiere, dice que soy el hombre de su vida y no hay otro igual... La verdad no la entiendo!
Sobre el tema del mail, es como un juego, es una forma que se siente diferente, que le hacia reír y la mantenía entretenida. Le pedí por favor que cortara de inmediato, que me estaba haciendo mucho daño, pero, sigue manteniendo el contacto.
Ahora estamos separados temporalmente, y estoy sufriendo mucho, tengo miedo de perderla. ¿Qué puedo hacer para no perderla?