¿Hay qué llevar dos contabilidades?

Me gustaría saber, soy autónomo en estimación directa simplificada y dado de alta epígrafe 691,9 en reparación, si quiero darme de alta en compras al por mayor, ¿tengo que llevar dos contabilidades?, por una parte están las reparaciones, puedo darme de alta en otro epígrafe y así poder comprar al por mayor, sin tener que pagar recargo de equivalencia, es posible?

Gracias