Cómo realizar facturas

Buenas tardes, soy un profesional autónomo y tengo una duda sobre mis facturas. Presto servicios para una clínica y además de las facturas por mis servicios con el IVA y la retención correspondiente, también solicito al Colegio Profesional ciertos impresos oficiales que son para la clínica. ¿Cómo debo facturar dicho material a la Clínica ya que la factura del Colegio vienen a mi nombre?
Muchas gracias.